黃國昌揭露，肩負國家產業政策重任而成立的「科學城物流」，已在多方股權交易下，使中資背景疑雲的嘉里大榮，取得超過 60%的持股與經營權，讓台灣政府喪失對科學城物流的控制。黃國昌點名國策顧問秦嘉鴻、華航前董事長何煖軒、台糖前董事長黃育徵、科學城物流董市長陳榮泉等關鍵人物出面說明、呼籲檢調徹查究責，並強調科技部也應取消對科學城物流的高額優惠補貼。
黃國昌 21 日在臉書公布「國昌調查局 KC Investigation」專題影片，質疑「誰讓國家科學城淪為官商勾結犧牲品？」他說明，1998 年為了配合國家政策，設計由台糖、華航持有過半股權而成立的科學城物流，肩負運輸高科技產品、避免機敏資訊外洩的政策任務。客戶涵蓋科學園區許多廠商，包括台積電、智邦科技、艾司摩爾等重要高科技半導體產業，其長期享有國家提供土地、完全不收權利金、無合約限制期限等政策優惠。
黃國昌質疑，如此重要的泛公股物流公司竟在 2017、2018 年，透過一連串的股權交易，落入遭民團與民代質疑是紅色資本背景的嘉里大榮手上，取得超過 60% 的持股與經營權，完全控制科學城，且迄今為止，科學城物流仍享有由納稅人買單的政策優惠。
黃國昌指出，2017 年 4 月，新竹物流旗下新竹貨運，先將其持有科學城物流 6.07% 的持股出售給國策顧秦嘉鴻的益州化工。接著在秦嘉鴻動用黨政高層的穿針引線下，科學城物流股權出現了翻天覆地的改變。2017 年 8 月，新竹物流出面收購華航全部 26% 的持股股權，「讓科學城物流正式脫離政府掌控，喪失國營事業地位」，也讓新竹物流成為科學城最大股東。 在此同時，台糖也放棄其對科學城物流的優先承購權。2018 年 9 月 秦嘉鴻益洲化學將大約 3％ 股份讓給兒子秦錫鈞，使其獲利並不用繳稅。2018 年 11 月，嘉里大榮收購新竹物流、益洲化工、秦錫鈞的全部持股，掌控科學城物流 60% 股份，成為科學城物流新主人。
黃國昌直指，國營事業董事長、當朝紅人難辭其咎。他質疑，華航董事長何煖軒一口氣出售 26％ 股權，「如此重要的股權交易，竟然可以不經過董事會，交易的金額高達3億元以上，為何如此大膽，為何有這樣的權限，背後到底跟誰講好的這件事情。」並指出華航董事長何煖軒退休後，轉身成為新竹物流所屬仰德集團的總顧問，有配車及辦公室，質疑是酬庸，「這樣子不知道利益迴避，這樣的利益輸送給新竹物流，何煖軒，你欠台灣人民一個道歉。」
黃國昌續指，依照契約，華航出售持股台糖享有優先承購權，此設計便是讓國家不會喪失對科學城物流的掌控。沒想到，原先扶持、將科學城物流視為金雞母的台糖，經華航通知後，在未提報董事會情況下，放棄優先承購權，黃國昌質疑時任台糖董事長黃育徵，當時是否讓經濟部長、行政院長知道，「有哪些黨政高層跟你摸過頭，希望你能夠消極配合？」
黃國昌更指出，關鍵人物秦嘉鴻在 2016 年成為當朝新貴以後，竟然沒有基本的分際，透過精密設計的股權交易將將對國家重要的科學城物流，雙手奉給嘉里大榮。黃國昌質問秦嘉鴻，到底找了哪些國營事業董市長、黨政高層來參與喬事、會議，「你必須站出來給全體人民一個清楚的交代。」此外，黃國昌也質疑，當時科學城物流董市長陳榮泉先生是否知情，是否讓政府知道，當中是否有關說、施壓、喬事的會議。
黃國昌表示，嘉里大榮母公司為香港嘉里物流，老闆是紅頂商人郭鶴年，長期支持北京極權，其財團更加入統戰組織打壓香港民主自由的呼聲。過去，也有民代要求徹查嘉里大榮資本背景。而原已遭質疑為紅色資本的嘉里大榮，母公司今年 2 月宣布由中國順豐控股收購，展開密切合作，在此背景，手握高科技產業機敏資訊的科學城物流受嘉里大榮掌控，更加深了國安疑慮。
黃國昌呼籲，到底是誰讓國家科學城淪為官商勾結下犧牲品，檢調單位應就其中可能的官商勾結、利益輸送、特殊背信、違法逃稅等情事嚴肅追究，而科技部應該也取消科學城物流的高額優惠補貼，不該繼續慷納稅人之慨，支持親中資本。
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