台大在 3 月 24 日臨時校務會議，本來想以「這一兩年有37名教授兼職，在學校流程簽辦上，有 95％（即 35 名）的同意書都採追認」，綁架其他 34 名教授當人質，掩護管中閔就任台大校長；無奈教育部不買單（見下表），直指管「違法兼職」。台大自己恐怕得先檢討內部「特權兼職」的混亂管理，進行修正後，對外高喊「校園自主」，才能理直氣壯；否則只是淪為其他學校恥笑與讓畢業校友臉上無光的一場鬧劇。
違反相關法規
專案小組認為，台大校長地位崇高，對國家社會發展有莫大影響，教育部對於校長遴選，具有適法性審查權限。
管中閔在台大同意之前，台大與台灣大尚未有產學合作契約之際，即已兼任台灣大獨立董事等三職，違法事證明確，且未曾在遴選程序揭露，因行為違反法令，不應予以聘任。
法律報告直指，教育人員任用條例、公立各級學校專任教師兼職處理原則等規定，專任教育人員必須事先書面報經學校核准後，才得兼職，且以該兼職單位已與學校建立產學合作關係為必要條件。
另依台大專任教師兼任非政府機關職務簽辦表，台大規定亦以完成產學合作契約及學術回饋金契約，作為書面同意兼職之要件。
教育部判定依據
專案小組調查，管於去年 5 月 2 日提出的兼職簽辦表，申請兼職台灣大獨董期間為 106 年 6 月 14 日至 109 年 6 月 13 日，而據台大函文，台大是在 10 月 2 日才正式函知台灣大與管中閔同意兼職，因此可證管違法先行兼任台灣大獨董。
不僅如此，管中閔於去年 8 月 1 日提出的兼職簽辦表，台大副校長郭大維在去年 9 月 22 日代理校長才批可，管中閔卻是自同年 6 月 14 日起開始兼職台灣大審計委員及薪酬委員。
又依台灣大薪資報酬委員會運作情形表，管在去年 8 月 31 日已實際出席台灣大薪酬委員會運作，也就是在郭大維批可前，管中閔違法偷跑兼職，而此違法與管參選台大校長具有時序上緊密關聯，可認定兩者有重大關聯性。
至於國台辦兩度護航管中閔，顯得事有蹊蹺；本來只是「台大派系內鬥」，管中閔引國民黨勢力塑造「藍綠對決」，國台辦見獵心喜再拉高成「兩岸對決」。跟劉兆玄等「仁社」成員，力拱郭位擔任中研院長一樣，充滿「支那要控制台灣內部」的陰謀算計，反而害了管自己：
2018 年 3 月 28 日
國台辦發言人安峰山表示，廈門大學曾經說明過相關狀況，管中閔曾被廈門大學經濟學院聘為客座教授，但是不授課、不支酬。安峰山說：「管教授沒有在廈門大學擔任教職，也沒有開設專業課程，沒有擔任碩士或者博士生的指導老師。另外，也沒有領取過薪酬。我瞭解的情況大概就是這些。」
2018 年 4 月 25 日
國台辦發言人馬曉光表示，兩岸交流三十年來，許多台灣的專家學者來大陸從事兩岸教育和學術交流，在大陸相關專業領域擔任榮譽職務或者開設講座，這是正常的交流活動，是光明正大的事情，對兩岸都有利。而民進黨當局採取雙重標準，限制兩岸交流，打壓參與兩岸交流的人士，這是不得人心的。
柯文哲兩度插花看似奇怪，實則事關他的連任：
- 管中閔是國民黨員，正藍軍，對藍營來說，比丁守中更有吸引力
- 若藍營真的捧管中閔出來選台北市長，柯就無法操作被中央政府打壓，「裝弱勢」騙選票
- 更重要的是，管在支那到處兼職，關係比柯更好。柯花了三年多，猛舔中共懶叭、並向藍營交心 ，不就毀於一旦？
2018 年 3 月 24 日
柯文哲表示，管中閔上任固然有爭議，但不上任爭議會更大，所以他個人認為「就是給管中閔上任算了」。
2018 年 4 月 28 日
柯文哲說，自己實在不願意批評民進黨，但以他還是現任台大醫學院外科教授的身分來看，這嚴重侵犯大學自主，「不知道哪個白癡決定了這個政策」，應該檢討。
有網友觀察到，近來馬英九不敢面對自己齷齪的過去，在應訊時、故意接連兩次行使緘默權，其後再發聲明（第一次、第二次），力抗北檢的偵查；這與管中閔幾個月來「神隱」，卻發聲明（見下圖）對抗教育部的言行一模一樣，想把整個社會拉回「藍綠對抗」的老路。
該網友就期待，或許可以看到類似馬英九的「參選聲明」，我們也覺得非常有趣，可以增加年底選戰的可看性：
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